O Japão vivia uma sangrenta Guerra Civil para saber quem e qual tipo de governo iria lidera o País. Numa fase final do feudalismo japonês - o regime da época era o decadente Shogunato, as principais forças eram defendidas pelos samurais, verdadeiros guerreiros prontos para defender os seus ideais.
 

Entre todos, um destacou-se pela sua habilidade fora do comum no manejo da espada e pela quantidade de mortes que foi responsável - o que lhe valeu o apelido de Battousai, o Retalhador.
A guerra acabou e a era Meiji foi iniciada. Os antigos samurais, entretanto, perderam a sua respeitosa posição social e passaram a ser tratados como vagabundos, os chamados Rurouni.
Battousai, arrependido pelas mortes que causou, desapareceu sem deixar vestígios. Mas a sua lenda continuou viva...

Dez anos passaram e foi quando um simpático forasteiro chega aos arredores de Tóquio. Trazendo consigo uma espada incomum (esta espada tinha a lâmina invertida), até que se encontra com uma bela jovem chamada Kaoru. Era o início de uma nova fase na vida de Kenshin Himura.

A sua expressão e maneira de encarar as coisas faziam-no esquecer por momentos  que já tinha sido o temido Battousai. Determinado a se estabelecer e não tirar mais vida alguma, vê na sua amizade com Kaoru a oportunidade que esperava para sossegar. Mas seu passado jamais o deixaria...